El programa ALTERNATIVAS se implementa en Guatemala en los municipio de Villa Nueva, Ciudad de Guatemala y Quetzaltenango. Además de trabajar en cooperación las municipalidades de ambas ciudades, se trabaja a nivel nacional con el Ministerio de Desarrollo Social – MIDES de Guatemala y con organizaciones de la sociedad civil.
El programa ALTERNATIVAS se implementa en El Salvador en los municipios de San Salvador, Zacatecoluca, San Miguel y Ahuachapán. También se apoya al Centro de Atención Integral al Migrante Retornado, ubicado en el barrio La Chacra en San Salvador. A nivel nacional, ALTERNATIVAS articula esfuerzos con la Secretaría Técnica y de Planificación de la Presidencia de la República – SETEPLAN, con el Ministerio de Relaciones Exteriores, y con organizaciones no gubernamentales, así como cooperantes internacionales.
En Honduras el programa interviene en los municipios de La Tegucigalpa, Comayagua, Lima . También se apoya a la Unidad Municipal de Atención a Retornados – UMAR ubicada en la ciudad capital, Tegucigalpa. A nivel nacional, ALTERNATIVAS articula esfuerzos con la Secretaría de Desarrollo e Inclusión Social – SEDIS, y con organizaciones no gubernamentales, así como cooperantes internacionales.